Диагностическое исследование проводится до начала антибактериальной терапии.
При исследовании отделяемого уретры у мужчин, сбор материала проводят до или не ранее 2–3 часов после мочеиспускания.
У женщин культуральное исследование не проводится во время менструации, так как в этот период микробная обсемененность резко снижается из-за кровотечения.